二维液相色谱-线性离子阱-轨道阱质谱联用仪 LTQ Orbitrap XL是蛋白质科学研究平台蛋白质组学技术实验室新增加的先进设备，于2009年11月安装调试完毕，现已正式对外提供服务。该仪器系统主要由二维高压液相色谱、纳喷（nanoESI）源、线性离子阱（LTQ）、轨道阱（Orbitrap）和电子转移裂解源（ETD）组成，该系统适合复杂样品分析，灵敏度高、能做多级串联质谱（n>10），其中Orbitrap具有高质量精度（<3ppm）和高分辨率(>100000)，该系统具有CID，HCD，ETD、PQD四种碎裂模式，其中ETD适合于进行翻译后修饰的研究。
2DLC-LTQ-Orbitrap XL ETD MS仪器系统鉴定蛋白质的可信度高，能用于（定量）蛋白质组学研究、蛋白质复合体的鉴定、低丰度蛋白质的分析鉴定、高通量的蛋白质翻译后修饰 (如磷酸化、糖基化、亚硝基化、甲基化和乙酰化等）研究、小分子化合物的结构测定、代谢组学和脂质组学研究等。
